受上游来水减少影响（由6月9日7000m³/s降到了6月17日的3800m³/s），西江航运干线长洲水利枢纽航段航道水位下降，使得贵港至梧州3000吨级航道整治二期工程施工河段长洲水利枢纽船闸至桂江河口段局部航道不能满足双向通航条件，大量超坝下航道实时水深下航船舶在长洲水利枢纽坝上待闸，截至6月21日8时，长洲船闸待闸船舶下航数共615艘。
梧州航道养护中心切实践行中国共产党成立100周年党史学习教育“学史力行”的基本要求，解决实际问题，确保船舶通航安全。从6月18日12时起，长洲水利枢纽至桂江河口河段临时实施单向通航（期间海事、交通、航道等部门合力对该航段实施临时单向交通管制），以此来逐步疏解下航待闸船舶，确保其安全通过坝下航道最小水深的航段。实施单向通航后待闸船舶每天过闸430至450艘。
此前为充分考虑货物水路运输的巨大需求，响应航运企业诉求，梧州航道养护中心经过努力排除各种不利因素，在落实系列安全保障措施情况下，利用施工空档期、丰水期，已于5月26日恢复上述施工河段长洲水利枢纽坝下至桂江河口段双向通航。恢复双向通航后，长洲船闸每日最大通过船舶数量较之前增加60至80艘船舶，达到每日过闸500至520艘。经过几天的运行调度，长洲船闸航段待闸船舶数逐步减少，上游的藤县、平南、桂平、贵港等地的码头港口货物大量囤积的形势也得到有效缓解。至2021年6月3日，持续多天的西江黄金水道通航突发事件所有应急响应得到全面解除。此次双向通航总共实施了23天。
据统计，2021年 5月，长洲水利枢纽船闸货物通过量1851.9万吨，同比增长28.3%，较单月历史最高位增长242.0万吨。为了继续保障船舶通航安全，持续保持安全形势稳定，梧州航道养护中心将继续加强水情监测，督促长洲船闸优化调度方式，待水位合适再抓住时机恢复双向通航，以满足水路运输需求。
