2020年4月1日，自治区人民政府出台《北部湾港集装箱进出口环节对标提升工作方案》，旨在进一步优化北部湾港集装箱进出口环节流程，有效解决制约集装箱进出北部湾港的效率和成本问题，提升北部湾港综合服务水平，营造良好的营商环境，加快北部湾国际门户港建设。

《方案》总体目标是实现北部湾港集装箱进出口部分环节流程再造、通关流程进一步优化、企业申报办理便利化程度进一步提升，对比2019年，到2020年底，北部湾港集装箱进口环节总体耗时压缩35%左右，综合费用降低33%左右，出口环节总体耗时压缩20%左右，综合费用降低17%左右，缩小与国内一流港口差距，形成区域竞争优势；对比2019年，到2021年底，北部湾港集装箱进口环节总体耗时压缩45%左右，综合费用降低45%左右，出口环节总体耗时压缩30%左右，综合费用降低30%左右，达到国内一流港口水平，区域竞争优势显著增强。

《方案》指出，在降低费用方面，北部湾港将建立完善收费目录制度，进一步明晰项目内容及边界，确保目录之外无收费；在国际贸易“单一窗口”公布口岸费用情况，支持第三方开展口岸费用评估，对不合理收费行为予以清理规范，依法查处各类违法违规收费问题。在压缩时间措施方面，将通过推进流程再造优化，优化通关作业方式，提高企业申报便利化程度，提升集装箱业务运营服务水平等四个方面压缩进出口环节时间。

自治区港航发展中心将在提升集装箱业务运营服务水平方面承担部分责任。主要是推进泊位申请、拖轮和船舶引航等线上申请，优先保障集装箱船舶进出港；探索引航管理体制改革，加强引航员队伍建设，充实引航员力量，加强引航员培训。同时，自治区港航发展中心将按照自治区交通运输厅要求，配合推进实施降低费用措施。